• 陈凯(Kai Chen)

    教授,博士生导师

    一、教育及工作经历

    2015年7月-2018年10月 美国普林斯顿大学 博士后

    2013年7月-2015年6月 美国斯托尔斯医学研究所 博士后

    2008年1月-2013年6月 美国斯托尔斯医学研究所 发育生物学 博士

    2005年9月-2007年12月 中国科学院昆明动物研究所 细胞生物学 硕士学习

    2001年9月-2005年7月 兰州大学生命科学学院 生物科学 学士

    二、主要研究方向

    1.合子基因组启动的分子机制;
    2.早期胚胎发育的转录调控网络;
    3.灵长类神经分化的转录调控;

    4.多通路高灵敏ChIP-Seq方法的开发

    三、科研领域描述

    长期从事早期胚胎发育的转录调控研究,发现合子基因组启动过程中核心启动子的差异性使用,首次运用单细胞测序揭示神经脊在脊索动物的进化来源,成功结合单细胞测序和发育生物学手段揭示多巴胺神经元终末分化保守的调控策略。现主要研究脊索动物胚胎发育调控网络和灵长类干细胞神经分化中转录调控机理,主要包括合子基因组启动的调控机制和转录调控网络。

    四、承担科研项目情况

    2015年7月-2018年10月 美国国立卫生研究院 主要参与人

    2013年7月-2015年6月 美国国立卫生研究院 主要参与人

    2008年1月-2013年6月 美国国立卫生研究院 主要参与人

    五、代表性论文

    1. Raimundo, J., Yamazaki, Y., Lim, B., Levine, M.*, Chen, K.* Core promoter usage shift during Drosophila midblastula transition. (Co-corresponding author, preparing manuscript)
    2. Cao, C., Lemaire, L., Choi, AY., Yoon, PH., Zhang, Z., Parsons, L., Matese, J., Wang, W., Levine, M.*, Chen, K.* A comprehensive four-dimensional single cell transcriptome analysis of a proto-vertebrate (Co-corresponding author, preparing manuscript)
    3. Horie, T.#, Horie, R.#, Chen, K.#, Cao, C.#, Nakagawa, M., Kusakabe, TG., Satoh, N., Sasakura, Y., Levine, M. (2018) Regulatory cocktail for dopaminergic neurons in a proto-vertebrate identified by whole embryo single cell transcriptomics. Genes & Development, (Published in Advance September 18, 2018, doi: 10.1101/gad.317669.118)
    4. Horie, R.#, Hazbun, A.#, Chen, K.#, Cao, C., Wang, W., Parsons, L., Levine, M., Horie, T. (2018) Shared evolutionary origin of vertebrate neural crest and cranial placodes. Nature. 560: 228–232
    5. Sun, YJ., Nien, CY., Chen, K., Liu, HY., Johnston, J., Zeitlinger, J., Rushlow, C. (2015). Zelda overcomes the high intrinsic nucleosome barrier at enhancers during Drosophila zygotic genome activation. Genome Research. 25: 1703-1714
    6. Wang, YL., Duttke, S., Chen, K., Johnston, J., Kassavetis, G., Zeitlinger, J., Kadonaga, J. (2014). TRF2, but not TBP, Mediates the Transcription of Ribosomal Protein Genes. Genes & Development 28: 1550-1555.
    7. Chen, K., Johnston, J., Shao, W., Meier, S., Staber, C., Zeitlinger, J. (2013) A global change in RNA polymerase II pausing during Drosophila midblastula activation. eLIFE 2:e00861.
    8. Lagha, M., Bothma, J.P., Esposito, E., Stefanik, L., Tsui, C., Johnston, J., Chen, K., Gilmour, D.S., Zeitlinger, J., and Levine, M. (2013). Paused Pol II Coordinates Tissue Morphogenesis in the Drosophila Embryo. Cell 153, 976–987.
    9. Gaertner, B., Johnston, J., Chen, K., Wallaschek, N., Paulson, A., Garruss, A.S., Gaudenz, K., De Kumar, B., Krumlauf, R., and Zeitlinger, J. (2012). Poised RNA polymerase II changes over developmental time and prepares genes for future expression. Cell Rep. 2, 1670–1683.
    10. Chen, Y., Wang, Z., Xie, Y., Guo, X., Tang, X., Wang, S., Yang, S., Chen, K., Niu, Y., and Ji, W. (2012). Folic acid deficiency inhibits neural rosette formation and neuronal differentiation from rhesus monkey embryonic stem cells. J. Neurosci. Res. 90, 1382–1391.
    11. Wang, S., Shen, Y., Yuan, X., Chen, K., Guo, X., Chen, Y., Niu, Y., Li, J., Xu, R.-H., Yan, X., et al. (2008). Dissecting signaling pathways that govern self-renewal of rabbit embryonic stem cells. J. Biol. Chem. 283, 35929–35940.

    六、实验室成员

    孙珂 (硕士研究生)

     

    实验室招聘博士后(若干名), 助理研究员和副研究员

    要求获得生物学博士学位,有发育生物学,分子生物学、生物材料、细胞培养或动物模型工作经验;具有较好的研究背景,并在SCI期刊上以第一作者或通讯作者发表过较好的研究论文;具有独立研究工作能力和合作精神,善于交流,有良好的文字表达能力和协调沟通能力;有较强的英语听、说、读、写能力。

     

    All Posts
    ×