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昆明理工大学灵长类转化医学研究院生物信息大数据平台

单位介绍

省部共建非人灵长类生物医学国家重点实验室(以下简称“国重”)是在昆明理工大学灵长类转化医学研究院和云南中科灵长类生物医学重点实验室的基础上组建,于2021年经国家科技部批准建设运行,围绕国家发展战略目标。“国重”开展以人口健康为导向,以非人灵长类生物医学为核心的重大基础科学问题和复杂疾病机制与治疗的应用基础研究,设置灵长类生殖与发育调控、灵长类干细胞与组织工程、灵长类动物模型与疾病机制研究等三个研究方向,在灵长类基础和应用基础等研究在国际上处于领先水平,持续在国际顶级杂志发表了一系列有重大国际影响的成果。2014年首次实现了基因编辑猴模型(Cell,2014;Cell Stem Cell 2014),被麻省理工评论(MITReview)评为当年十大科技突破,《Nature》评为里程碑式的工作;2015年首次证明了灵长类胚胎干细胞等多能性(Cell Stem Cell,2015),为干细胞再生医学奠定了理论基础;2017年建立了人类RTT综合症等一批猴模型(Cell,2017等),解决了一些其它物种(如啮齿类)所不能回答的重要疾病表型和机制问题;2019年突破猴胚胎体外长时间培养20天(Science,2019),首次阐述了人胚胎三维条件原肠发育(Nature,2020)。首次发现了灵长类胚胎发育的一些重要分子调控机制、及其与啮齿类明显差异的事实,对解析发育生物学和干细胞多能性等前沿基础科学问题,促进人们对灵长类早期着床后平台发育以及出生缺陷和发育障碍机制理解有重要意义。团队的优秀成果刊登于《Cell》、《Science》、《nature》等优秀期刊上。国重现有科研实验面积3000余平米,包括基因工程实验室、遗传学实验室、干细胞实验室、模型分析实验室、灵长类动物实验平台、蛋白平台、先进影像平台和生物信息大数据平台在内功能齐全的实验空间。此外,重点实验室拥有可容纳1000余只灵长类动物的室外动物房和300笼位的室内动物房,所有动物实验设施均通过国际AAALAC认证。正在筹建新实验楼计划占地面积15亩,建筑面积约20000平方米,包括实验楼、实验动物楼和检疫楼。依靠上述平台,重点实验室先后主持承担国家重点研发计划、国家基金委重点基金、联合基金、地区基金、面上项目等多项国家级、省部级科研项目。近年来主持项目经费近2亿元。详细介绍请登录http://www.lpbr.cn      

生物信息大数据平台于2019年6月在灵长类转化医学研究院统一领导和支持下,通过整合研究院内的生物信息学分析人才和计算资源而建立。平台建立的目的是作为研究院生物信息分析的支撑平台,同时进行灵长类生物大数据的存储、共享和展示,有效利用研究院产生的基因组、转录组、蛋白质组、代谢组、影像学等多组学数据。平台拥有服务器6台、深度学习GPU服务器1台,存储3台(存储>3000TB、CPU>500核心、内存>5TB)等硬件设备,能够满足在数据分析和存储方面的大量计算资源需求。平台已经建立主要包括普通转录组数据分析、单细胞转录组、单细胞atac-seq、全基因组重测序分析、蛋白学分析、代谢组学分析、宏基因组、chip-seq、多组学整合分析等众多分析流程。平台致力于开发多组学、多平台、异质性多组学数据整合方法,实现从高通量多组学数据分析到医学知识的快速转化。      

目前生物信息大数据平台建设成果丰硕,初步构建了灵长类多组学综合数据库。近三年来,平台团队取得了显著成果,合作发表了10余篇SCI论文,其中包括《Cell》、《Protein & Cell》、《Nature Communications》和《Science Advances》等高影响论文。目前平台正在迅速发展,承担多项重要任务,因此公开招聘2名科研为主型教师,诚邀海内外优秀科研人员加入

岗位招聘名称和人数

岗位:科研为主型教师,从事生物信息学相关研究;

人数:2名。

应聘条件

1. 获得生物信息学及生物学相关专业(包括生物学、计算机、自动化、数学等)博士学位;

2. 以第一作者身份发表SCI学术论文至少1篇;

3. 对生物信息学研究和转化有强烈兴趣,熟练使用R、Python、Perl等编程语言中的一种,熟悉linux操作环境;

4. 工作态度认真负责,善于沟通和交流,有良好的团队精神、合作与服务意识。

岗位职责

在研究院和平台整体协调下,开展以下工作的一项或多项:

  1. 与研究院课题组合作开展科学研究,基于研究院各课题组的分析需求,进行生物信息学分析合作;
  2. 建立灵长类多组学数据库;
  3. 在灵长类动物发育与衰老、干细胞多能性以及复杂疾病机制等研究领域,自由探索和开展研究工作;
  4. 平台其他相关工作。

岗位待遇

1.本次公开招聘的工作人员,正式聘用后纳入事业单位编制内管理;

2.按照昆明理工大学聘任岗位级别提供有竞争力的薪酬待遇,给予灵活的考评机制,为青年研究人员扎根学术、潜心研究重大问题和原创新科学问题营造良好环境;

3. 国重在校内实行“人才特区”政策,通过“人才特区”引进的PI和优秀青年研究人员实行年薪制,各层次岗位一事一议,提供优厚年薪、住房保障、平台建设支持、充足的科研经费、子女入学保障等。

招聘程序

1. 发送个人简历及其它能证明科研能力的相关材料至邮箱yangnx@lpbr.cn,招聘小组根据岗位应聘条件的规定对应聘者进行资格审查,资格审查通过后将通过电子邮件或电话通知竞聘者面试时间及地点;

2. 竞聘答辩:答辩将安排应聘者对自身情况以及专业技能、工作设想及计划等以ppt形式进行阐述,之后进行专家提问。招聘小组根据竞聘者的综合业务能力进行评分后确定候选人;

3. 邮件标题请注明“应聘-生物信息研究-姓名”;

Email: yangnx@lpbr.cn

地址:昆明市呈贡区景明南路;邮编:650500

4. 招聘信息在职位满额前一直有效。欢迎志同道合、热爱科学研究者应聘,与我们共同努力,一起成长。